Proteomica is de studie van het proteoom, de reeks eiwitten die op een bepaald moment door het genoom (al het erfelijke materiaal dat een organisme bezit) worden geproduceerd. Met proteomisch onderzoek kan een beeld verkregen worden van de eiwitten die op een bepaald moment in een organisme aanwezig zijn. Eiwitten worden meestal afgebroken tot peptiden en daarna gedetecteerd met massaspectrometrische technieken. Proteomica kan dus, door de proporties van verschillende aminozuren in biologisch weefsel, tot op soortniveau bepalen welke eiwitten aanwezig zijn. Aminozuren kunnen ook worden gebruikt om te dateren, middels AAR (Amino Acid Racemization). Gemengde eiwitrijke materialen kunnen zelfs meerdere bronnen aantonen, bijv. melkeiwitten van geit/schaap of eigeel van kip.